藥物官能團對生物活性的影響總結如下：
| 官能團 | 對生物活性影響 | 舉例 |
| 一般能使脂溶性加大，水溶性變差的基團 | ||
| 烴基（火字旁，火上澆油，脂溶性增加） | 改變溶解度、解離度、分配系數，位阻↑，穩定性↑ | 環己巴比妥引入甲基→海索比妥，不易解離 |
| 鹵素（吸電子，脂溶性） | 影響電荷分布、脂溶性及作用時間 | 安定作用：氟奮乃靜＞奮乃靜 |
| 巰基 | 形成氫鍵能力比羥基低，但脂溶性高，更易吸收 | 解毒藥：與重金屬形成不溶性硫醇鹽 |
| 醚和硫醚 | 醚類在脂-水交界處定向排布，易通過生物膜 | 硫醚類可氧化成亞砜或砜，極性↑（風流黃：有硫，可成亞砜或砜，磺） |
| 酰胺 | 增強與受體的結合能力 | 構成受體或酶的蛋白質和多肽結構中含有大量的酰胺鍵 |
| 非季銨的胺類 | N上有未共用電子對，顯堿性，易與受體形成氫鍵 | 活性：伯胺＞仲胺＞叔胺（伯仲叔按年齡排序，大哥活性強） |
| 磺酸酯、羧酸酯 | 成酯，脂溶性↑，易吸收 | 酯類前藥：增加吸收，減少刺激 |
| 一般能使水溶性加大，脂溶性變差的基團 | ||
| 季銨（金戈鐵馬） | 季銨易電離成穩定的銨離子 | 作用強，水溶性大，難透過生物膜，往往無中樞作用；但可穿透細菌的細胞壁，如四代頭孢 |
| 羥基（脫胎于H2O，水溶性強） | 增強與受體結合力，水溶性↑，改變活性 | （1）脂肪鏈上：活性和毒性下降 （2）芳環上：酸性、活性和毒性增強 （3）成酯/成醚：活性降低 |
| 磺酸、羧酸（酸可在堿性條件下成鹽，水溶性增強） | 引入磺酸基使水溶性和解離度↑，不易吸收，僅有磺酸基一般無活性； 引入羧酸水溶性解離度較磺酸小 |
磺酸和羧酸成酯：脂溶性增加，易吸收 |
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